Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP1BQ14684 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP1BQ14684 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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