Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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GBX1Q14549 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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GBX1Q14549 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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GBX1Q14549 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GBX1Q14549 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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