Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 SMC6-210ENST00000621152 500 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.564e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-204ENST00000428868 544 ntTSL 49.11□□□□□ -0.954e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.644e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SMC6-202ENST00000381272 1803 ntTSL 53.98□□□□□ -1.774e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.54e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.744e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.692e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 NPSR1-AS1-201ENST00000358772 550 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.264e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 NPSR1-AS1-204ENST00000431669 369 ntTSL 1 (best)4□□□□□ -1.774e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRSF11-216ENST00000489188 784 ntTSL 24.33□□□□□ -1.722e-12■□□□□ 10
HLTFQ14527 ACIN1-221ENST00000557432 642 ntTSL 312.72□□□□□ -0.371e-18■□□□□ 10
HLTFQ14527 ACIN1-208ENST00000553721 610 ntTSL 39.86□□□□□ -0.831e-18■□□□□ 10
HLTFQ14527 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)16.53■□□□□ 0.244e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 49.51□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.78□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-10■□□□□ 10
HLTFQ14527 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.941e-10■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.971e-10■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRRM2-225ENST00000576076 914 nt17.03■□□□□ 0.321e-8■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRRM2-224ENST00000575870 696 ntTSL 310.98□□□□□ -0.651e-8■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRRM2-209ENST00000572278 711 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-8■□□□□ 10
HLTFQ14527 SRRM2-215ENST00000573498 994 ntTSL 35.9□□□□□ -1.461e-8■□□□□ 10
HLTFQ14527 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.275e-9■□□□□ 10
HLTFQ14527 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-9■□□□□ 10
HLTFQ14527 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■□□□□ 10
HLTFQ14527 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.29□□□□□ -1.563e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.851e-10■□□□□ 10
HLTFQ14527 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.594e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 412.18□□□□□ -0.464e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 212.13□□□□□ -0.474e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 MIB1-203ENST00000578260 544 ntTSL 46.53□□□□□ -1.364e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 MIB1-202ENST00000577749 726 ntTSL 54.24□□□□□ -1.734e-7■□□□□ 10
HLTFQ14527 DLGAP1-AS1-205ENST00000576606 391 ntTSL 35.5□□□□□ -1.533e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DLGAP1-AS1-203ENST00000574411 408 ntTSL 35.4□□□□□ -1.543e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DLGAP1-AS1-204ENST00000575606 344 ntTSL 35.03□□□□□ -1.63e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DLGAP1-AS1-202ENST00000573355 180 ntTSL 33.68□□□□□ -1.823e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DLGAP1-AS1-206ENST00000577995 414 ntTSL 33.64□□□□□ -1.833e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 59.53□□□□□ -0.881e-10■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 NRIP1-204ENST00000411932 720 ntTSL 35.97□□□□□ -1.451e-12■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.212e-18■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF331-219ENST00000513929 1424 ntTSL 218.32■□□□□ 0.521e-13■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 NEK9-206ENST00000555537 675 ntTSL 28.45□□□□□ -1.064e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF331-220ENST00000513999 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.981e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-57■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.043e-41■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 26.03□□□□□ -1.447e-26■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.346e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 215.5■□□□□ 0.076e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 DNAH14-218ENST00000498360 951 ntTSL 313.67□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.486e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 PDIA3-206ENST00000497349 739 ntTSL 26.75□□□□□ -1.336e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-202ENST00000558243 770 ntTSL 514.55□□□□□ -0.086e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.286e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-203ENST00000558527 791 ntTSL 212.86□□□□□ -0.356e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-205ENST00000559081 578 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.696e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-207ENST00000559475 463 ntTSL 29.63□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SRP14-206ENST00000559439 743 ntTSL 36.73□□□□□ -1.336e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.296e-10■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-10■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.766e-10■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-226ENST00000494621 871 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-213ENST00000466330 746 ntTSL 314.96□□□□□ -0.011e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-212ENST00000464375 626 ntTSL 314.38□□□□□ -0.111e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-216ENST00000475743 590 ntTSL 414.25□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-214ENST00000466975 560 ntTSL 413.28□□□□□ -0.281e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 NKTR-213ENST00000472258 576 ntTSL 24.24□□□□□ -1.736e-7■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 28.33□□□□□ -1.085e-8■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 ZNF146-205ENST00000591063 533 ntTSL 24.49□□□□□ -1.695e-8■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.773e-6■□□□□ 9.9
HLTFQ14527 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.573e-6■□□□□ 9.9
Retrieved 100 of 6,978 protein–RNA pairs in 57.7 ms