Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE1CQ14123 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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