Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6HQ13956 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PDE6HQ13956 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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PDE6HQ13956 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6HQ13956 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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