Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1CQ13936 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1CQ13936 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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