Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMC2Q13753 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms