Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATRQ13535 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATRQ13535 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATRQ13535 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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