Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PPP1R1AQ13522 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PPP1R1AQ13522 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms