Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMED1Q13445 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED1Q13445 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms