Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3B2Q13367 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
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