Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATMQ13315 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATMQ13315 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATMQ13315 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATMQ13315 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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