Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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SKP2Q13309 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SKP2Q13309 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SKP2Q13309 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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SKP2Q13309 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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SKP2Q13309 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SKP2Q13309 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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