Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERCC8Q13216 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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ERCC8Q13216 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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ERCC8Q13216 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERCC8Q13216 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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