Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RESTQ13127 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RESTQ13127 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RESTQ13127 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RESTQ13127 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RESTQ13127 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RESTQ13127 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RESTQ13127 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RESTQ13127 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RESTQ13127 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
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