Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
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