Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK3Q13003 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK3Q13003 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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