Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NFX1Q12986 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFX1Q12986 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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