Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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BNIP1Q12981 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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