Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXF2Q12947 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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