Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXO1Q12778 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FOXO1Q12778 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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