Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCAPQ12770 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCAPQ12770 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCAPQ12770 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCAPQ12770 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCAPQ12770 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCAPQ12770 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCAPQ12770 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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