Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 SHE4YOR035C 2370 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 HPA3YEL066W 540 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YGR018CYGR018C 330 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SRL3YKR091W 741 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MRPL33YMR286W 261 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 RPL16BYNL069C 597 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 ISW1YBR245C 3390 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 CWC22YGR278W 1734 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 TOR1YJR066W 7413 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PRM8YGL053W 714 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YGR053CYGR053C 852 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 CIC1YHR052W 1131 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 RPF1YHR088W 888 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YJL086CYJL086C 369 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 RUF22RUF22 515 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PET123YOR158W 957 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 ALG14YBR070C 714 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PIS1YPR113W 663 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MAL33YBR297W 1407 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 DNF1YER166W 4716 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SKO1YNL167C 1944 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 RIX1YHR197W 2292 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MET6YER091C 2304 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 DNA2YHR164C 4569 nt2.81□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 NET1YJL076W 3570 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SIR3YLR442C 2937 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PHR1YOR386W 1698 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 STN1YDR082W 1485 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YCR064CYCR064C 411 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PEX4YGR133W 552 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 LSM8YJR022W 330 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MRPL38YKL170W 417 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 KTI11YBL071W-A 249 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SCD5YOR329C 2619 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SCY1YGL083W 2415 nt2.8□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 NUM1YDR150W 8247 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 TMA64YDR117C 1698 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 TAE2YPL009C 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YCR090CYCR090C 549 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YDR537CYDR537C 606 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 FYV7YLR068W 456 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YLR379WYLR379W 375 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 COX8YLR395C 237 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MRPL44YMR225C 297 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YNL122CYNL122C 348 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YOR331CYOR331C 558 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SNX41YDR425W 1878 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 EAP1YKL204W 1899 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 HOP1YIL072W 1818 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PCK1YKR097W 1650 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MAK5YBR142W 2322 nt2.79□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PBS2YJL128C 2007 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 RVS161YCR009C 798 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YGR045CYGR045C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YIR020CYIR020C 303 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 EAF6YJR082C 342 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 ATP3YBR039W 936 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SWD3YBR175W 948 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YFR016CYFR016C 3702 nt2.78□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 SUL1YBR294W 2580 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 MRM2YGL136C 963 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YJR157WYJR157W 363 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 TAP42YMR028W 1101 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YPR177CYPR177C 372 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SNU56YDR240C 1479 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YDR338CYDR338C 2088 nt2.77□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SAK1YER129W 3429 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SMY2YBR172C 2223 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SIP3YNL257C 3690 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YCR001WYCR001W 315 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 VPS74YDR372C 1038 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 CHZ1YER030W 462 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 MXR1YER042W 555 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 BER1YLR412W 825 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 PEX17YNL214W 600 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YOR169CYOR169C 465 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 OSW7YFR039C 1533 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 PSY2YNL201C 2577 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 MED1YPR070W 1701 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 RGL1YPL066W 1440 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.76□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 MSH4YFL003C 2637 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YKU80YMR106C 1890 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 SRB4YER022W 2064 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 IRC8YJL051W 2469 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 IRC2YDR112W 309 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 YGL159WYGL159W 1113 nt2.75□□□□□ -1.97
LSP1Q12230 RSR1YGR152C 819 nt2.75□□□□□ -1.97
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