Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC15Q0P6D6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms