Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C2orf54Q08AI8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms