Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLFN5Q08AF3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms