Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DSC1Q08554 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DSC1Q08554 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms