Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
GOLGA3Q08378 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GOLGA3Q08378 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GOLGA3Q08378 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms