Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDR1Q08345 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDR1Q08345 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms