Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLEQ07864 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POLEQ07864 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms