Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPL18Q07020 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms