Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNG1Q06432 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG1Q06432 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms