Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TLE4Q04727 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms