Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OCA2Q04671 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OCA2Q04671 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms