Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	FIR1	YER032W	2631 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SSQ1	YLR369W	1974 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	REF2	YDR195W	1602 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	PUT3	YKL015W	2940 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	DAD1	YDR016C	285 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	AIM18	YHR198C	966 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SFM1	YOR021C	642 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YRO2	YBR054W	1035 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	ALY1	YKR021W	2748 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	NPR3	YHL023C	3441 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	PNC1	YGL037C	651 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YHR050W-A	YHR050W-A	171 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	ATG38	YLR211C	681 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	COX8	YLR395C	237 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	IRC21	YMR073C	606 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YPR014C	YPR014C	330 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	CYR1	YJL005W	6081 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YKL075C	YKL075C	1353 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	NOP19	YGR251W	591 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YJL147C	YJL147C	1149 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	CWC24	YLR323C	780 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RPS16A	YMR143W	432 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RBL2	YOR265W	321 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YCL023C	YCL023C	348 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SCY1	YGL083W	2415 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YIP1	YGR172C	747 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	UTP15	YMR093W	1542 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YCT1	YLL055W	1596 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	MFB1	YDR219C	1398 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	GCD10	YNL062C	1437 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	BFR1	YOR198C	1413 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	PBP4	YDL053C	558 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	NYV1	YLR093C	762 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	RSA1	YPL193W	1146 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	PIS1	YPR113W	663 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	COG3	YER157W	2406 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	MST27	YGL051W	705 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YGR109W-A	YGR109W-A	873 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YIL082W	YIL082W	873 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YJL086C	YJL086C	369 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	YOL085W-A	YOL085W-A	213 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	Q04048	MES1	YGR264C	2256 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	SIP3	YNL257C	3690 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	RSM18	YER050C	417 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	PRP38	YGR075C	729 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	COQ10	YOL008W	624 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	UBX3	YDL091C	1368 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	INP53	YOR109W	3324 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	GPI19	YDR437W	423 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	SNO3	YFL060C	669 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	MND1	YGL183C	660 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	PRP21	YJL203W	843 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	FPR1	YNL135C	345 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	GIM3	YNL153C	390 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	SNO2	YNL334C	669 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YAP7	YOL028C	738 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YOL029C	YOL029C	606 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	MIX23	YBL107C	591 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	DNL4	YOR005C	2835 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	snR76	snR76	109 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	RPS26B	YER131W	360 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ECM9	YKR004C	1134 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	LCL1	YPL056C	306 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	VID24	YBR105C	1089 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	TRZ1	YKR079C	2517 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	PUF4	YGL014W	2667 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ATP7	YKL016C	525 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YPR147C	YPR147C	915 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	DAL5	YJR152W	1632 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	Q04048	ADK1	YDR226W	669 nt		2.79	□□□□□ -1.96

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