Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID5AQ03989 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID5AQ03989 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms