Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUCB1Q02818 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUCB1Q02818 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms