Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRF8Q02556 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms