Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SATB1Q01826 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SATB1Q01826 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms