Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK3Q00526 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK3Q00526 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms