Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms