Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNA1P78396 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms