Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ASIC1P78348 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC1P78348 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms