Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HBBP68871 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HBBP68871 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HBBP68871 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HBBP68871 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HBBP68871 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HBBP68871 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HBBP68871 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HBBP68871 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms