Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBB4BP68371 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBB4BP68371 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms