Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2L3P68036 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2L3P68036 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms