Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P63121 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERVK_113P63121 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms