Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2HP62256 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2HP62256 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms