Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVPABLB-1P60509 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVPABLB-1P60509 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms