Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM33P57088 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM33P57088 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms